Il museo è sorto formalmente per mezzo di una Delibera del Comune di Mazara del Vallo, la numero 2168 del 15 novembre 1984, e per mezzo di una successiva convenzione stipulata con l'Unione Cacciatori di Mazara, approvata il 17 dicembre 1985. Secondo tale convenzione, la collezione ornitologica-tassidermica di proprietà dell'unione cacciatori venne messa a disposizione del pubblico
